Powikłania po skleroterapii należą do rzadkości. Zaczerwienienie i niewielkie pobolewanie leczonego żylaka jest częścią procesu leczenia. W około 5% przypadków mogą wystąpić niewielkie brązowe przebarwienia związane z wydostawaniem się krwi i drażniącego środka z przekłutego żylaka. Większość przebarwień mija po kilku tygodniach. Bardzo rzadko, szczególnie u palaczy, wydostający się z nastrzykiwanego żylaka drażniący środek może spowodować punktową rankę skóry. Najpoważniejszym, ale bardzo rzadkim (0.1% przypadków) powikłaniem skleroterapii jest zakrzepica żył głębokich. Szczegółowe omówienie wymienionych powikłań oraz sposobów ich leczenia powinno mieć miejsce podczas konsultacji przedoperacyjnej, która jest najwłaściwszą okazją do wyjaśnienia wszelkich wątpliwości.