Poprzez kilkumilimetrowe nakłucia skóry za pomocą odpowiednio wyprofilowanych narzędzi chirurg usunie zmienione odcinki żył. Zwykle do usunięcia zmienionego naczynia wystarcza jedno lub dwa wkłucia. W przypadkach, w których zmieniona żyła jest długa i bardzo kręta konieczne może być wykonanie większej ilości wkłuć. Ran po usunięciu żylaków mikrometodą nie szyje się a jedynie skleja za pomocą specjalnych plasterków tzw. Steri-stripów. Zabieg kończy założenie uciskowej opaski na zoperowaną kończynę.