Z uwagi na to, że Botox jest białkiem, po jego podaniu istnieje możliwość wystąpienia objawów grypopodobnych (stan podgorączkowy, bóle mięśni, zmęczenie). Możliwe jest również wystąpienie nudności, wymiotów i bólów głowy. Dolegliwości te ustępują w ciągu kilku dni. W rzadkich przypadkach może dojść do osłabienia mimiki twarzy (maskowatość), niedostatecznej korekcji zmarszczek oraz nieplanowanego porażenia mięśni w okolicach wstrzyknięcia preparatu wskutek jego rozprzestrzenienia się poza miejsce podania.