Każda metoda leczenia wiąże się z ryzykiem wystąpienia efektów ubocznych. Ocenia się, że efekty uboczne występują ogółem u około 11% pacjentów leczonych Botoxem z powodu nadmiernej potliwości. Najczęstsze z nich to:
- objawy grypopodobne - stan pod-gorączkowy, bóle głowy, bóle mięśniowe, niekiedy nudności i wymioty. Dolegliwości te ustępują samoistnie w ciągu kilku dni po wstrzyknięciu preparatu.
- nadmierna potliwość innych części ciała - występuje u ok. 4.5% pacjentów. Objaw ten, jeżeli wystąpi, jest najbardziej uciążliwy w ciągu pierwszego miesiąca terapi stając się potem coraz mniej zauważalnym.
- niewielkie osłabienie siły mięśni ramion - w rzadkich przypadkach niewielkie ilości Botoxu mogą przenikać z miejsca wstrzyknięcia do okolicznych nerwów zaopatrujących mięśnie ramion. U około 0.7% pacjentów może to powodować osłąbienie ich siły. Objaw ten ma przemijający charakter i ustępuje bez konieczności leczenia.